Большинство оставшихся органелл являются везикулами, или биологическими "мешочками", в некотором роде. Тела Гольджи, которые при микроскопическом исследовании имеют характерную структуру «стопки блинчиков», содержат недавно синтезированные белки; тела Гольджи высвобождают их в маленькие пузырьки, отщипывая их, и в этот момент эти маленькие тела имеют свою собственную закрытую мембрану. Большинство этих маленьких везикул попадают в эндоплазматический ретикулум, который похож на шоссе или систему железных дорог для всей клетки. К некоторым видам эндоплазматических клеток прикреплено множество рибосом, что придает им «грубый» вид под микроскопом; соответственно, эти органеллы называются шероховатой эндоплазматической сетью или RER. Напротив, эндоплазматический ретикулум без рибосом называется гладким эндоплазматическим ретикулумом, или SER.

Клетки также содержат лизосомы, везикулы, которые содержат мощные ферменты, которые расщепляют отходы или нежелательных посетителей. Это как сотовый ответ уборщицам.