Прокариотические клетки не имеют отдельной области внутри, заключенной в оболочку для хранения генетического материала. Вместо этого ядерное тело в прокариотической клетке, называемой нуклеоидом, обычно содержит одну круговую хромосому, состоящую из ДНК. Прокариотические клетки не имеют плотной сферической структуры, называемой ядрышком, который содержит ядро. ДНК внутри прокариотической клетки становится основой для дочерних клеток, когда прокариотическая клетка размножается.
Прокариотические клетки размножаются бинарным делением.

Как разнообразные и невероятно обильные мелкие формы жизни, микробиологи обычно каталогизируют бактерии по трем основным, но отличным формам: кокк, палочка или спираль.
 

Кокк: появляются в виде овальных или сферических клеток.

Жезл: Также называется бациллой, они звучат как палочка.

Спираль. Эти бактериальные клетки выглядят под микроскопом одним из трех способов: вибрионы или запятая; спирилл, толстая штопороподобная клетка; или спирохета с тонкой, более гибкой формой штопора.

Но это не единственные формы одноклеточных бактерий. Другие формы включают лопастные, нитевидные, множественные формы различных типов, оболочечные, веретенообразные, стеблевые, звездообразные и трихомообразующие бактерии.

Процесс окрашивания по Граму, первоначально разработанный датским врачом Гансом Кристианом Грамом, является еще одним методом, который микробиолог использует для идентификации неизвестных бактерий. Этот процесс имеет два результата: грамотрицательный или грамположительный. Тест включает использование разноцветных пятен, которые сигнализируют о способности клетки поглощать пятно или нет. Химический состав клеточных стенок клеток прокариотических бактерий определяет, каким цветом становятся клетки бактерий.

Исследователи считали, что прокариотическая клетка, которая теперь называется цианобактерией, принадлежит к домену Eukarya в царстве растений. При ближайшем рассмотрении они обнаружили, что прокариотическая клетка не имела отчетливого ядра и что в ней также отсутствовали хлоропласты, небольшие части растений, которые содержат единицы, называемые пластидами, в которых происходит фотосинтез.

Прежде чем исследователи обнаружили, что археи отличаются от бактерий, они называли их архебактериями, а не бактериями. Эти одноклеточные организмы существуют между Бактериальным и Эукарьяским царствами, разделяя некоторые клеточные характеристики обоих, обладая уникальными собственными характеристиками.

Мембраны в прокариотических клетках архей состоят из разветвленных углеводородных цепей, а их клеточные стенки не содержат пептидогликанов. Некоторые прокариотические клетки археи реагируют на антибиотики, которые воздействуют на клетки в домене Eukarya, но не реагируют на некоторые из антибиотиков, к которым чувствительны некоторые бактерии. Материал рРНК у архей полностью отличается от генетического материала, обнаруженного в клетках прокариотических бактерий. Большинство других характеристик клеток архей сходны с чертами бактерий прокариотических клеток.